144 Deteksi Virus Classical Swine Fever di Bali dengan RT-PCR (DETECTION OF CLASSICAL SWINE FEVER VIRUS IN BALI WITH RT-PCR) I Wayan Wirata 1 , Ida Ayu Sri Chandra Dewi 1 , I Gusti Ngurah Narendra Putra 1 , Ida Bagus Oka Winaya 2 , Ida Bagus Kade Suardana 3 , Tri Komala Sari 3 , I Nyoman Suartha 4 , I Gusti Ngurah Kade Mahardika 1* 1) Laboratorium Biomedik Veteriner Jl Sesetan Gang Markisa No. 6 Denpasar-Bali, telp. 0361-8423062; 2) Laboratorium Patologi Veteriner; 3) Laboratorium Virologi Veteriner; 4) Laboratorium Penyakit Dalam Hewan Besar, Fakultas Kedokteran Hewan Universitas Udayana, Jl. P.B Sudirman, Denpasar, Tlp. (0361) 223791 Email: drh.wirata@gmail.com *Korespondensi: gnmahardika@indosat.net.id ABSTRACT Classical Swine Fever (CSF) virus has been confirmed for the first time in pig in Bali. The object of this study was suspected CSF cases diagnosed at the diagnostic laboratory assistantship of the Faculty of Veterinary Medicine, Udayana University, in 2007-2008. Total number of cases was 12. Case records included the signalment of case (breed, age, body weight, and the origin of respective case), clinical signs, post-mortem lesions, and histological pictures. CSF virus was confirmed using the standardized reverse transcriptase-polymerase chain reaction (RT-PCR) for CSF from European Union. One RT-PCR product was sequenced. CSF virus was confirmed in seven out of 12 cases (58%). The cDNA sequence was confirmed to be specific of CSF E2 protein coding region with 98% homology to one isolate from China that was available in GeneBank. Further works are recommended to elucidate the sensitivity of RT-PCR, to clarify some differential diagnose, and to find out the genetic variation of CSF virus in Bali. Key words: classical swine fever virus, Bali, RT-PCR Key words: classical swine fever virus, Bali, RT-PCR PENDAHULUAN Classical Swine Fever (CSF) atau yang dikenal dengan nama Hog cholera merupakan salah satu penyakit menular yang secara ekonomi paling penting pada babi di dunia (Fenner et al., 2003). Penyakit ini menyebabkan kerugian ekonomi yang besar karena biaya eradikasi serta vaksinasi yang sangat mahal. Penyakit itu disebabkan oleh virus dari keluarga Flaviviridae, genus Pestivirus (Fenner et al., 2003). Dalam genus itu, virus CSF bergabung bersama virus diare sapi (bovine viral diarrhea/ BVD). Kedua virus itu juga mempunyai hubungan antigenik (OIE, 2008). Laporan ilmiah tentang isolasi dan identifikasi CSF tidak tersedia di Indonesia. Akan tetapi, vaksin untuk pencegahannya telah dipasarkan sejak puluhan tahun terakhir ini. Hal yang sama terjadi di Bali. Selama ini, diagnosis penyakit CSF umumnya dilakukan dengan melihat gejala klinik dan lesi-lesi bedah bangkai pada hewan penderita. Berdasarkan pendekatan itu, penyakit CSF sering dikelirukan dengan penyakit lain. Diagnosis banding antara lain African swine fever, porcine dermatitis and nephropathy syndrome (PDNS), post-weaning multisystemic wasting syndrome (PMWS), thrombocytopenic purpura, salmonellosis, erysipelas, pasteurellosis, actinobacillosis, dan infeksi Haemophilus parasuis (OIE, 2008) . Berbagai agen bakteri yang tersebut tadi memang sering menyebabkan infeksi ikutan sehingga menutupi kasus CSF (Gregg, 2002). Oleh karena itu peneguhan diagnosis penyakit menjadi amat penting. Peneguhan penyakit dengan teknik reverse transcriptase- polymerase chain reaction (RT-PCR) dilaporkan Jurnal Veteriner September 2010 Vol. 11 No. 3 : 144-151 ISSN : 1411 - 8327