Recep Keşli 1 , Hüseyin Bilgin 2 , Yaşar Ünlü 3 , Gökhan Güngör 4 1 Selçuk Üniversitesi Tıp Fakültesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Konya, Türkiye; 2 Uludağ Üniversitesi Tıp Fakültesi, Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Anabilim Dalı, Çocuk Metabolizma ve Beslenme Bilim Dalı, Bursa, Türkiye; 3 Sağlık Bilimleri Üniversitesi, Konya Eğitim ve Araştırma Hastanesi, Patoloji Anabilim Dalı, Konya, Türkiye; 4 Selçuk Üniversitesi Tıp Fakültesi, İç Hastalıkları Anabilim Dalı, Gastroenteroloji Bilim Dalı, Konya, Türkiye Helicobacter pylori İnfeksiyonu Tanısında Kültür, Hızlı Üreaz Testi ve Histopatolojinin Tanı Değerlerinin ve Çeşitli Antimikrobiyallerin Helicobacter pylori’ye Karşı In Vitro Etkilerinin İncelenmesi Evaluation of Diagnostic Performance of Culture, Rapid Urease Test and Histopathology in the Diagnosis of Helicobacter pylori Infection, and In Vitro Activity of Various Antimicrobials Against Helicobacter pylori ÖZET Amaç: Çalışmada, dispeptik şikayetlerle başvuran hastalardan alınan mide antrum biyopsi örneklerinde, hızlı üreaz testi (HÜT), kültür ve histoloji yöntemleriyle Helicobacter pylori infeksiyonu varlığının araştırılması; izolatların amoksisilin, klaritromisin, levofloksasin ve metronidazole karşı dirençlerinin antibiyotik gradyan yöntemiyle belirlenmesi amaçlandı. Yöntemler: Antrum ve korpus bölgelerinden alınan 278 biyopsi örneğinin mikrobiyolojik ve histopatolojik incelemeleri yapıldı. Biyopsi örneklerinde H. pylori varlığı; kültür, histoloji ve HÜT testleri ile araştırıldı. İzolatların; amoksisilin, kla- ritromisin, levofloksasin ve metronidazole karşı antimikrobiyal dirençleri antibiyotik gradyan yöntemiyle tespit edildi. Kültür altın standard yöntem olarak belirlendi ve histoloji ve HÜT için duyarlılık ve özgüllük hesaplandı. Ayrıca histoloji ve HÜT’ün birlikte pozitifliği altın standard kriteri kabul edilerek kültür için duyarlılık ve özgüllük oranları hesaplandı. Bulgular: Çalışmada, H. pylori pozitifliği; 278 hastanın 140’ında kültür, 174’ünde histoloji ve 191’nde HÜT ile belir- lendi. Kültür, histoloji ve HÜT yöntemlerinin duyarlılık oranları %76.5 ve %88.3, %87.8 ve özgüllükleri %63, %94.2 ve %57.2 olarak tespit edildi. Kültürden izole edilen 140 H. pylori suşunda antibiyotik gradyan yöntemiyle antibiyotik direnci araştırıldı; amoksisilin, klaritromisin, levofloksasin ve metronidazole karşı direnç oranları sırasıyla 9 (%6.4), 22 (%15.7), 17 (%12.1), 57 (%40.7) olarak tespit edildi. Sonuçlar: Çalışmada; kültür, HÜT ve histoloji yöntemleri arasında en duyarlı testin HÜT olduğu görüldü. Kültür yönteminin özgüllüğünü yüksek olarak tespit etmemize rağmen, duyarlılığı diğer yöntemlere göre oldukça düşüktü. H. pylori kültürünün duyarlılığının düşük olması; bakterinin nazlı, güç üreyen bir mikroorganizma olması, klinik örneğin alınması ve transport koşullarının izolasyon şansını doğrudan etkilemesi gibi faktörlerden kaynaklanabilir. Anahtar Kelimeler: H. pylori, histopatoloji, hızlı üreaz testi, kültür, antimikrobiyal direnç Bu çalışma Creative Commons Atıf-GayriTicari-Türetilemez 4.0 Uluslararası Lisansı ile lisanslanmıştır. Cite this article as: Keşli R, Bilgin H, Ünlü Y, Güngör G. [Evaluation of diagnostic performance of culture, rapid urease test and histopathology in the diagnosis of Helicobacter pylori infection, and in vitro activity of various antimicrobials against Helicobacter pylori ]. Klimik Derg. 2022;35(1):36-9. Turkish. Sorumlu Yazar / Correspondence: Recep Keşli, E-posta / E-mail: recepkesli@gmail.com, Geliş / Received: 26 Ekim / October 2020, Kabul / Accepted: 03 Kasım / November 2021, Yayın Tarihi / Published Date: 28 Mart / March 2022, DOI: 10.36519/kd.2022.3573 ÖZGÜN ARAŞTIRMA ORIGINAL ARTICLE Klimik Dergisi 2022; 35(1): 36-9 ABSTRACT Objective: e aim of this study, is to investigate the presence of Helicobacter pylori (H. pylori) infection by culture, histology and rapid urease test (RUT) in gastric antrum biopsy samples taken from patients presenting with dyspeptic complaints and to determine the resistance of the isolates to amoxicillin, clarithromycin, levofloxacin and metronida- zole by antibiotic gradient method (E-test). Methods: Microbiological and histopathological examinations of 278 biopsy specimens taken from antrum and corpus regions were performed. e presence of H. pylori in biopsy samples was investigated by culture, histology and RUT. Antimicrobial resistance of the isolates against amoxicillin, clarithromycin, levofloxacin and metronidazole was de- termined by antibiotic gradient method. Sensitivity and specificity of histology and RUT were calculated by accepting culture as the gold standard. Sensitivity and specificity for culture was also calculated by taking the co-positivity of both histology and RUT as the gold standard. Results: H. pylori positivity was detected in 140 of 278 patients with culture, 174 with histology, and 191 with RUT. Sensitivity and specificity of the culture, histology and RUT methods of the patients were 76.5% and 88.3%, 87.8% and 63%, 94.2% and 57.2%, respectively. Antibiotic resistance was investigated by antibiotic gradient method in 140 H. pylori strains isolated from culture. e resistance rates of H. pylori strains to the amoxillin, clarithromycin, levoflox- acin and metronidazole were detected as 9 (%6.4), 22 (%15.7), 17 (%12.1), 57 (%40.7), respectively. Conclusions: In the study, RUT was found to be the most sensitive test among culture, histology and RUT methods. Although the specificity of the culture method was high, its sensitivity was found to be quite low compared to other methods. e low sensitivity of H. pylori culture may be caused by factors that affect the chances of direct isolation such as dealing with a fastidious microorganism, clinical sample retrieval and transport conditions. Keywords: H. pylori, histopathology, rapid urease test, culture, antimicrobial resistance