517 Sarapata K i wsp. Encyklopedia semantyczna - odpowiedź na wymagania dietetyka
Encyklopedia semantyczna – odpowiedź na wymagania
dietetyka
Semantic encyclopedia – a response towards requirements of dieticians
Krzysztof Sarapata
1/
, Paweł Góra
1/
, Grzegorz J. Nalepa
2/
, Weronika T. Adrian
2/
, Krzysztof Kluza
2/
,
Marta Noga
2/
1/
Zakład Bioinformatyki i Telemedycyny, Collegium Medicum Uniwersytet Jagielloński, Kraków
2/
Katedra Automatyki, Akademia Górniczo-Hutnicza, Kraków
The project of dietetic and medical encyclopedia (eHealthWiki and Diki
(Diet Wiki)) is a case of an Internet-based encyclopedia using a wiki system
enhanced with a semantic module. The contents of the encyclopedia
are related to both medicine and dietetics. In the paper new features
provided by the Semantic MediaWiki system used in the encyclopedia are
outlined. A use case of a diet for patients with celiac disease is presented.
The objectives of the project are both scientific and methodological in
the dietetic science. The encyclopedia uses widely available medical
and biological databases to categorize and group concepts. The use case
described in the paper concerns the existence of gluten in dietary products
in the same taxonomical branch.
Key words: diet, human nutrition, semantics
Projekt encyklopedii dietetyczno-medycznej w wersjach: eHealthWiki i Diki
(Diet Wiki) jest przykładem internetowej encyklopedii typu wiki poszerzonej
o moduł semantyczny. Tematyka encyklopedii plasuje się na styku medycyny
i dietetyki. W pracy zaprezentowane zostały możliwości, które wprowadza
encyklopedia semantyczna, konkretnie Semantic MediaWiki (SMW).
Ponadto pokazano przykładowy rekord wraz z zależnościami semantycznymi
dotyczący diety eliminacyjnej zalecanej w celiakii. Warto zwrócić uwagę, że
oprócz waloru centralizacji i aktualności informacji zawartej w encyklopedii,
projekt posiada aspiracje naukowe, jako narzędzie metodologiczne
w dietetyce. Wykorzystanie zasobów kategoryzacji dostępnych w biologii
i medycynie (taksonomia biologiczna, baza toksyczności i inne) pozwala na
grupowanie, własną kategoryzację i stawiania hipotez. W pracy pokazano
to na przykładzie występowania glutenu w produktach pochodzących
z tej samej gałęzi taksonomicznej czy występujących w grupie produktów
pochodnych.
Słowa kluczowe: dieta, żywienie człowieka, semantyka
Adres do korespondencji / Address for correspondence
Mgr inż. Krzysztof Sarapata
Zakład Bioinformatyki i Telemedycyny, Uniwersytet Jagielloński
Collegium Medicum, ul. Kopernika 7, 31-501 Kraków
tel./fax 12-422-77-64, e-mail: mysarapa@cyf-kr.edu.pl
© Probl Hig Epidemiol 2010, 91(4): 517-521
www.phie.pl
Nadesłano: 10.08.2010
Zakwalifikowano do druku: 27.11.2010
Wstęp
Dostępne oprogramowanie wspierające pracę
dietetyków: Wikt [1], Programy Dietetyk i Dieta 4
[2], Dietetyk [3], Energia [4] ma zastosowanie
w dziedzinie planowania i analizy żywienia człowieka.
Niezależnie od praktycznego stosowania programów
informatycznych zarówno lekarz jak i dietetyk zobo-
wiązani są do regularnego poszerzania wiedzy na pod-
stawie nowych doniesień naukowych, a w konsekwen-
cji do aktualizacji receptur i diet w różnego rodzaju
chorobach. Encyklopedia eHealthWiki poprzez swoje
walory staje się użytecznym narzędziem ułatwiającym
zarówno aktualizację wiedzy, jak i wspomaganie lecze-
nia w dziedzinie żywieniowej.
Powstająca internetowa encyklopedia eHealthWiki
zbiera informacje dostępne w źródłach internetowych
i papierowych dotyczących medycyny oraz problema-
tyki żywienia człowieka. Jej celem jest koncentracja, ale
nie powielanie, wiedzy o tematyce żywieniowej i me-
dycznej. Wykorzystuje zasoby istniejące w Internecie
oraz w wersji drukowanej, które sukcesywnie przenosi
się do postaci elektronicznej. Dzięki wprowadzeniu
oryginalnej struktury przechowywanych danych, en-
cyklopedia umożliwia dynamiczne kategoryzowanie
wg kryterium najistotniejszego z punktu widzenia
żywienia człowieka określania stopnia toksyczności
produktów żywnościowych. Encyklopedia bazuje na
wypracowanych koncepcjach w dietetyce [5,6,7].
Dostępne systemy kategoryzowania danych bio-
logicznych i medycznych, np. taksonomia biologiczna
stosują różne podejścia i kryteria grupowania. Przykła-
dowo tzw. analizę filogenetyczną przeprowadza się na
podstawie sekwencji genomowych rodów organizmów
i opiera się na określaniu ilości kroków potrzebnych
ARTYKUłY POGLąDOWE / REVIEW PAPERS