Pesq. agropec. bras., Brasília, v.48, n.3, p.263-269, mar. 2013 DOI: 10.1590/S0100-204X2013000300004 Associação de marcadores moleculares SNP com o conteúdo de ácido linolênico em sementes de soja Marcos de Oliveira Pinto (1) , Pedro Ivo Vieira Good‑God (2) , Maurílio Alves Moreira (3) e Everaldo Gonçalves de Barros (4) (1) Embrapa Milho e Sorgo, Rodovia MG 424, Km 65, CEP 35701‑970 Sete Lagoas, MG. E‑mail: marcosbqiufv@yahoo.com.br (2) Universidade Federal de Viçosa (UFV), Campus Rio Paranaíba, Rodovia MG 230, Km 7, Caixa Postal 22, CEP 38810‑000 Rio Paranaíba, MG. E‑mail: pedro.god@ufv.br (3) UFV, Departamento de Bioquímica e Biologia Molecular, Avenida P.H. Rolfs, s/n o , CEP 36570‑000 Viçosa, MG. E‑mail: moreira@ufv.br (4) UFV, Departamento de Biologia Geral, Viçosa, MG. E‑mail: ebarros@ufv.br Resumo – O objetivo deste trabalho foi validar a associação de marcadores moleculares do tipo “single nucleotide polymorphism” (SNP) para os genes FAD3A, FAD3B e FAD3C com o conteúdo de ácido linolênico (18:3) em sementes de soja e analisar a influência dos parâmetros genéticos destes marcadores nesta característica. Foram genotipadas 185 progênies F 2 derivadas do cruzamento entre A29 (mutante para os três genes FAD3, 1% de 18:3) e Tucunaré (genótipo selvagem, 11% de 18:3). Os marcadores moleculares para os genes FAD3A, FAD3B e FAD3C explicaram a variação do conteúdo de 18:3 nas populações segregantes F 2 e F 2:3 . Além disso, as substituições alélicas no loco FAD3A proporcionam maiores variações no conteúdo de 18:3 que as substituições nos outros dois locos. Termos para indexação: Glycine max, FAD3A, FAD3B, FAD3C, 18:3, substituição alélica. Association of SNP markers with the linolenic acid content in soybean seeds Abstract – The objective of this work was to validate the association of single nucleotide polymorphism (SNP) markers for the genes FAD3A, FAD3B, and FAD3C with the linolenic acid content (18:3) in soybean seeds and to analyze the influence of the genetic parameters of these markers on this trait. One hundred and eighty‑five F 2 progenies derived from a cross between A29 (mutant for the three FAD3 genes, 1% 18:3 content) and Tucunaré (wild‑type genotype, 11% 18:3 content) were genotyped. The molecular markers for genes FAD3A, FAD3B, and FAD3C explained the variations in 18:3 content of the F 2 and F 2:3 segregating populations. In addition, allelic substitutions in the FAD3A locus provide greater variations in 18:3 content than substitutions in the other two loci. Index terms: Glycine max, FAD3A, FAD3B, FAD3C, 18:3, allelic replacement. Introdução As propriedades físico‑químicas e biológicas do óleo são diretamente afetadas pela sua composição de ácidos graxos. A grande diversificação na utilização do óleo de soja [Glycine max (L.) Merr.] tem demandado o desenvolvimento de genótipos com composição modificada de ácidos graxos, mais adequada a cada tipo de produto. Em razão da baixa estabilidade oxidativa do ácido linolênico (18:3), há interesse no desenvolvimento de genótipos de soja que apresentem baixos teores deste ácido, principalmente para aplicações na indústria alimentícia e na produção de biodiesel (Gerde et al., 2007; Knothe, 2007; Farhoosh et al., 2009; Ramos et al., 2009; Santos et al., 2013). A síntese de 18:3 é catalisada por ω‑3‑dessaturases, tendo o ácido linoleico (18:2) como substrato (Baud & Lepiniec, 2010). Três genes (FAD3A, FAD3B e FAD3C) que codificam ω‑3‑dessaturases afetam diretamente o acúmulo de 18:3 em sementes de soja (Bilyeu et al., 2003). Genótipos mutantes, com baixos teores de 18:3, já tiveram os alelos do gene FAD3A bem caracterizados, o que tem permitido o desenvolvimento de marcadores moleculares do tipo “single nucleotide polymorphism” (SNP). Bilyeu et al. (2003) caracterizaram os três genes (FAD3A, FAD3B e FAD3C) responsáveis pelo conteúdo de 18:3 em sementes de soja. No gene FAD3A da linhagem A5, foi identificada uma deleção que permite distinguir o alelo mutante dos alelos