X Simpósio de Pesquisa dos Cafés do Brasil – ISSN: 1984-9249 8 a 10 de outubro de 2019, Vitória – ES ESTUDO DE ASSOCIAÇÃO GENÔMICA AMPLA PARA INTERAÇÃO de Coffea arabica L. E Pseudomonas syringae pv. garcae 1 Caroline Ariyoshi 2 ; Gustavo César Sant’ana 3 ; Gustavo Hiroshi Sera 4 ; Lucas Mateus Rivero Rodrigues 5 ; Lívia Maria Nogueira 6 ; Rafaelle Vicchia Ferreira 7 ; Mariane Silva Felício 8 ; Bruna Silvestre Rodrigues da Silva 9 ; Fernanda Freitas de Oliveira 10 ; Larissa Girotto 11 ; Suzana Tiemi Ivamoto 12 ; Douglas Silva Domingues 13 ; Luiz Filipe Protasio Pereira 14 1 Trabalho financiado pelo Consórcio Brasileiro de Pesquisa e Desenvolvimento do Café – Consórcio Pesquisa Café e pela Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (Capes) 2 Bolsista Capes, MS, carolineariyoshi@hotmail.com 3 Pesquisador, PhD, Tropical Melhoramento e Genética, Cambé-PR, gustavocsantana80@gmail.com 4 Pesquisador, PhD, Instituto Agronômico do Paraná, Londrina-PR, gustavosera@iapar.br 5 Bolsista INCT, PhD, lucasmriverorodrigues@gmail.com 6 Bolsista Capes, PhD, livia.nogueira@hotmail.com 7 Bolsista Capes, PhD, rafaelle.ferreira@gmail.com 8 Bolsista Capes, MS, marianesfelicio@gmail.com 9 Bolsista Consórcio Pesquisa Café, PhD, brunasilvestrerodrigues@hotmail.com 10 Bolsista Capes, MS, fernandafreitasdeoliveira92@gmail.com 11 Bolsista Capes, MS, larissagirotto@yahoo.com.br 12 Bolsista Fapesp, PhD, suzanatiemi@yahoo.com.br 13 Pesquisador, PhD, Universidade Estadual Paulista, doug@rc.unesp.br 14 Pesquisador, PhD, Embrapa Café, filipe.pereira@embrapa.br RESUMO: O objetivo deste trabalho foi explorar os recursos genéticos de genótipos de Coffea arabica L. do centro de origem para identificar regiões genômicas associadas à resistência a mancha aureolada. Para isto, 101 genótipos de C. arabica da coleção da Etiópia FAO e 11 cultivares foram sequenciados e genotipados através da técnica de genotipagem por sequenciamento (GBS). O GBS resultou em 6.210.920 tags que foram alinhadas ao genoma de C. arabica e resultou na identificação de 10.650 SNPs (Single Nucleotide Polymorphism). O mesmo material vegetal também foi avaliado fenotipicamente para resistência a mancha aureolada, causada pela Pseudomonas syringae pv. garcae. A fenotipagem varia entre altamente imune à altamente suscetível. Com esses dados, utilizando o programa FASTmrEMMA foi feito um Estudo de Associação Genômica Ampla. Como resultado, 5 SNPs, com alto potencial para Seleção Assistida, foram associados à resistência a mancha aureolada. Além disso, foi possível identificar genes próximos aos SNPs relacionados ao mecanismo de defesa das plantas. Entre esses estão genes que codificam as proteínas serina/treonina quinase e a CC-NB-LRR. PALAVRAS-CHAVE: mancha aureolada do cafeeiro, gene R, seleção assistida. GENOME WIDE ASSOCIATION STUDY FOR Coffea arabica L. AND Pseudomonas syringae pv. garcae INTERACTION ABSTRACT: The aim of this work was to explore the genetic resources of Coffea arabica L. genotypes, from its center of origin, in order to identify genomic regions associated to resistance to bacterial halo blight. For that, 101 Ethiopian C. arabica genotypes and 11 cultivars were genotyped using GBS technique (Genotyping by Sequencing). The GBS resulted in 6.210.920 tags that were aligned to the C. arabica genome and 10.650 SNPs (Single Nucleotide Polymorphism) were selected. The same plant collection was phenotypically evaluated for resistance to bacterial halo blight that is caused by Pseudomonas syringae pv. garcae. The phenotyping varies between highly immune to highly susceptible. Using the program FASTmrEMMA a Genomic Wide Association Study was performed. As a result, 5 SNP, with high assisted selection potential, were associated with bacterial halo blight. In addition, it was possible to identify candidate genes, in the proximity of the SNPs associated, related to plant defense, such as serine/threonine kinase and CC-NB-LRR. KEY WORDS: bacterial halo blight, R gene, assisted selection. INTRODUÇÃO A incidência de doenças é um dos principais fatores de redução da produção cafeeira. Entre as doenças bacterianas temos a mancha aureolada, causada pela Pseudomonas syringae pv. garcae (AMARAL; TEIXEIRA; PINHEIRO, 1956), a qual vem se espalhando pelos estados de São Paulo, Paraná e Minas Gerais (RODRIGUES et al., 2017; ZOCCOLI; TAKATSU; UESUGI, 2011). A doença é predominante em regiões de clima moderado, expostas ao vento e sujeitas a longos períodos de alta humidade relativa (SERA, 2001). Levando - se em conta que o manejo da mancha aureolada é baseado em químicos e quebra-ventos este se torna difícil e com alto custo. Dessa forma, uma das melhores formas de controle da doença é a obtenção de cultivares resistentes. Neste contexto, o uso de marcadores moleculares pode contribuir para acelerar a seleção de genótipos. Uma forma de identificar