ISSN 0206-5657. Віɫɧиɤ Льɜіɜɫьɤɨɝɨ ɭɧіɜеɪɫиɬеɬɭ. Сеɪія ɛіɨɥɨɝічɧɚ. 2012. Виɩɭɫɤ 60. С. 156–162
Visnвk of the Lviv Universitв. Series BIologв. 2012. Issue 60. P. 156–162
© Ɉɫɬɚɲ Ȼ., Ɂɚɛɭɪɚɧɧɢɣ ɇ., Ƚɨɪɛɚɥɶ Ʌ. ɬɚ ɿɧ., 2012
ȽȿɇȿɌɂɄȺ
ɍȾɄ 579.873.1:577.181.4
HOMOLOGUES OF PLEOTROPIC REGULATORY GENE adpA
IN ACTINOPLANES: ANALYSIS IN SIILICO
B. Ostash
1
, N. Zaburannyi
1,2
, L. Horbal
1
, A. Luzhetskyy
2
, S. Shulga
3
, V. Fedorenko
1
1
Ivan Franko National University of Lviv
4, Hryshevskyi St., Lviv 79005, Ukraine
e-mail: bohdanostash@gmail.com
2
Helmholtz Institute for Pharmaceutical Research, Saarland Campus
Building C2.3, 66123 Saarbrucken, Germany
3
Institute of Food Biotechnology and Genomics of NAS of Ukraine
2a, Osypovskyi St., Kyiv 04123, Ukraine
Actinoplanes teichomyceticus proНuМОs glвМopОptТНО КntТЛТotТМ tОТМoplКnТn, К “lКst
lТnО НОfОnsО” КgКТnst multТНrug rОsТstКnt МoММТ. TСО gОnО МlustОr for ЛТosвntСОsТs of tОТМo-
planin (tcp) СКs ЛООn МlonОН 8 вОКrs Кgo, КltСougС rОgulКtТon of Тts proНuМtТon Тs poorlв
unНОrstooН ЛОМКusО of lКМk of gОnОtТМ toolkТt to mКnТpulКtО tСТs strКТn Кs аОll Кs knoа-
lОНgО of Тts gОnomО orgКnТzКtТon. In strОptomвМОtОs, rОgulКtorв gОnО adpA encodes a master
rОgulКtor of sОМonНКrв КnН prТmКrв mОtКЛolТsm, Кs аОll morpСogОnОsТs, formТng tСО lКrgОst
gОnО “moНulon” knoаn to НКtО for ЛКМtОrТК. HОrО аО КnКlвzОН tСО possТЛТlТtв tСКt AНpA-lТkО
protОТn mТgСt ЛО ТnvolvОН Тn rОgulКtТon of tОТМoplКnТn proНuМtТon. АО usОН tСО НОsМrТЛОН
МonsОnsus AНpA opОrКtor sОquОnМОs, ТnfОrrОН from КnКlвsТs of strОptomвМОtО gОnomОs, to
sМrООn tСО tcp МlustОr. SОvОrКl putКtТvО AНpA opОrКtors аОrО rОvОКlОН аТtСТn tcp МlustОr,
ТmplвТng tСКt AНpA-lТkО trКnsМrТptТonКl fКМtors mКв ТnНООН opОrКtО Тn Actinoplanes. UsТng
МompКrКtТvО gОnomТМ КpproКМСОs, аО rОvОКlОН sОvОrКl putКtТvО adpA СomologuОs Тn Мom-
plОtОlв sОquОnМОН Actinoplanes gОnomОs Кs аОll Кs Тn НrКft sОquОnМО of A. teichomyceticus
gОnomО. TКkОn togОtСОr, our НКtК stronglв support tСО ТНОК tСКt adpA-mediated regulation
ТnluОnМОs tСО proНuМtТon of КntТЛТotТМs not onlв Тn gОnus Streptomyces, Лut Кlso Тn Actino-
planes.
Keywords: Actinoplanes, tОТМoplКnТn, AНpA, gОnomО КnКlвsТs.
Actinoplanes teichomyceticus Тs К rОprОsОntКtТvО of rКrО КnН sloа-groаТng КМtТnomвМОtОs
tСКt possОss motТlО sporОs КnН proНuМО sОМonНКrв mОtКЛolТtОs not founН Тn morО Мommon gОnОrК,
suМС Кs Streptomyces, Micromonospora or Saccharopolyspora Д17]. A. teichomyceticus is not
ОбМОptТon: Тt Тs tСО onlв knoаn proНuМОr of tОТМoplКnТn, К МlТnТМКllв vКluКЛlО glвМopОptТНО КМtТvО
КgКТnst vКnМomвМТn- КnН mОtСТМТllТn- rОsТstКnt МoММТ Д1, 5, 6, 14]. A. teichomyceticus СКs Кlso
ЛООn sСoаn Тn ОКrlв аorks to КММumulКtО sОМonН group of КntТЛТotТМs rОfОrrОН to Кs tОТМСomвМТn
A
1
МomplОб. It Тs ЛОlТОvОН to МonsТst of moОnomвМТn-lТkО КntТЛТotТМs Д1, 3, 12]. MuМС Оffort СКs
ЛООn put Тnto pСвsТologТМКl КnН gОnОtТМ stuНТОs on tОТМoplКnТn ЛТosвntСОsТs Д2, 4, 7, 13–16]. TСОrО
Тs groаТng ТntОrОst Тn ОбplorКtТon of A. teichomyceticus, КnН Actinoplanes Тn gОnОrКl, Кs К ЛКsТs
for tСО НОvОlopmОnt of К nОа МlКss of КntТЛТotТМs opОrКtТng tСrougС ТnСТЛТtТon of pОptТНoglвМКn
ЛТosвntСОsТs Д11, 12]. In tСТs rОgКrН, Тt Тs ОssОntТКl to ОбplorО Кll possТЛlО аКвs to stТmulКtО sОМ-
onНКrв mОtКЛolТsm of КМtТnoplКnОtОs, аСТМС аТll lОКН to ТmprovОmОnt of proНuМtТon of knoаn
КntТЛТotТМs Кs аОll Кs to КМtТvКtТon of sТlОnt sОМonНКrв mОtКЛolomО. HОrО аО НОМТНОН to ОбplorО К
possТЛТlТtв tСКt knoаn plОТotropТМ rОgulКtors of sОМonНКrв mОtКЛolТsm of Streptomyces СКvО tСОТr
counterparts in Actinoplanes. PКrtТМulКrlв, аО foМusОН on gОnО adpA tСКt МoНОs for trКnsМrТptТonКl