West African Journal of Medicine Vol. 30, No. 2 March–April, 2011 † Department of Medical Microbiology and Parasitology, College of Medicine University of Lagos, Lagos, Nigeria; ‡ Anaerobe Laboratory, Department of Microbiology, Institute of Biomedical Sciences, University of São Paulo, SP, Brazil; § Department of Preventive Dentistry, College of Medicine, University of Lagos, Lagos, Nigeria. ¶ Department of Oral/Maxillofacial Surgery, College of Medicine, University of Lagos, Lagos, Nigeria. *Correspondence: Nwaokorie Francisca Obiageri; Phone 234-1-08037173766. E-Mail: franoby@yahoo.com Abbreviations: API, Analytical Profile Index; FAA, Fastidious Anaerobe Agar; FSA, Fasobacterium Selective Agar; PCR, Polymerase Chain Reaction; UV, Ultra-violet. Isolation and Molecular Identification of Fusobacterium nucleatum from Nigerian Patients with Oro-facial Infections L’isolement et l’identification moléculaire de Fusobacterium nucleatum de patients nigérians présentant une infection bucco-faciale F. O. Nwaokorie* † , A. O. Coker † , F. T. Ogunsola † , M. J. Avila-Campos ‡ , E. Gaetti-Jardim Jr. ‡ , P. O. Ayanbadejo § , K. A. Umeizudike § , O. T. Abdurrazaq ¶ ABSTRACT BACKGROUND: Fusobacterium nucleatum is one of the most common anaerobic bacteria present in the oral cavity and is often isolated from infections involving other body sites. OBJECTIVE: To characterise F. nucleatum strains from patients attending a teaching hospital in Nigeria in order to provide information on the methods for accurate identification of anaerobes in clinical specimen. METHODS: Fusobacterium nucleatum specie from 50 patients presenting with oro-facial infections were studied by culture on Fusobacterium selective agar and fastidious anaerobe agar. The isolates were characterised based on colonial morphology, microscopy, lipase production, susceptibility to kanamycin and colistin and resistance to vancomycin. Biochemical tests were performed using a commercial test kit. The identity of the isolates was confirmed based on molecular characterization performed using polymerase chain reaction (PCR) analysis. RESULTS: Forty-eight (96%) F. nucleatum isolates were obtained from the 50 patients by culture and all the isolates were identified by colonial appearance and microscopy based on their unique spindle shape with tapered ends. Only 26 (54.2%) of the 48 isolates were identified by commercial API 20A test kit while PCR confirmed the identity of all the isolates. CONCLUSION: Anaerobes are involved in human infections and their study is quite cumbersome due to tedious nature and high cost of the techniques involved. Cultural method is reliable in the isolation and identification of F. nucleatum species. PCR is a rapid and simple method that can complement the phenotypic identification of anaerobes and would assist in their full identification. WAJM 2011; 30(2): 125–129. Keywords: Anaerobes, Fusobacterium nucleatum, Oro-facial infections, Polymerase chain reaction. RÉSUMÉ CONTEXTE: Fusobacterium nucleatum est l’une des bactéries les plus courantes des anaérobies présentes dans la cavité buccale et est souvent isolé des infections de sites d’autres corps. OBJECTIF: Caractériser les souches de F. nucleatum chez de patients fréquentant un hôpital d’enseignement au Nigéria afin de fournir des informations sur les méthodes d’identification précise des bactéries anaérobies dans un échantillon clinique. METHODES: Fusobacterium nucleatum de 50 patients présentant des infections oro-faciales a été étudié par la culture sur agar sélectif et Fusobacterium anaérobie fastidieux. Les isolats ont été caractérisés en fonction de la morphologie coloniale, la microscopie, la production de lipase, la sensibilité à la kanamycine et colistine et la résistance à la vancomycine. Les tests biochimiques ont été réalisés en utilisant une trousse commerciale. L’identité des isolats a été confirmée sur la base caractérisation moléculaire effectuée en utilisant la réaction en chaîne par polymérase (PCR). RÉSULTATS: Quarante-huit (96%) isolats de F. nucleatum ont été obtenus à partir des 50 patients par la culture et tous les isolats ont été identifiés par l’aspect colonial et la microscopie en fonction de leur forme en fuseau unique aux extrémités effilées. Seulement 26 (54,2%) des 48 isolats ont été identifiés par le test du kit commercial API 20A. La confirmation de l’identité a été faite par PCR pour tous les isolats. CONCLUSION: Les anaérobies sont impliqués dans les infections humaines et leur étude est assez difficile en raison de la nature pénible et du coût élevé des techniques concernées . La méthode de culture est fiable dans l’isolement et l’identification des espèces F. nucleatum. La PCR est une méthode simple et rapide qui peut compléter l’identification phénotypique des bactéries anaérobies et aiderait dans leur identification complète. WAJM 2011; 30(2): 125–129. Mots-clés: Anaérobies, Fusobacterium nucleatum, Infections oro-faciales, la réaction en chaîne par polymérase. WEST AFRICAN JOURNAL OF MEDICINE ORIGINAL ARTICLE