Journal of Plant Physiology 175 (2015) 131–147 Contents lists available at ScienceDirect Journal of Plant Physiology journal h om epage: www.elsevier.com/locate/jplph Review article Parameters of photosynthetic energy partitioning Duˇ san Lazár ∗ Department of Biophysics, Center of the Region Haná for Biotechnological and Agricultural Research, Faculty of Science, Palack´ y University, ˇ Slechtitel˚ u 11, 783 71 Olomouc, Czech Republic a r t i c l e i n f o Article history: Received 27 August 2014 Received in revised form 22 October 2014 Accepted 25 October 2014 Available online 29 November 2014 Keywords: Quantum yield Photochemical Non-photochemical Chlorophyll fluorescence Photosynthesis a b s t r a c t Almost every laboratory dealing with plant physiology, photosynthesis research, remote sensing, and plant phenotyping possesses a fluorometer to measure a kind of chlorophyll (Chl) fluorescence induction (FLI). When the slow Chl FLI is measured with addition of saturating pulses and far-red illumination, the so-called quenching analysis followed by the so-called relaxation analysis in darkness can be realized. These measurements then serve for evaluation of the so-called energy partitioning, that is, calculation of quantum yields of photochemical and of different types of non-photochemical processes. Several theories have been suggested for photosynthetic energy partitioning. The current work aims to summarize all the existing theories, namely their equations for the quantum yields, their meaning and their assumptions. In the framework of these theories it is also found here that the well-known NPQ parameter (= (F M - F ′ M )/F ′ M ; Bilger and Björkman, 1990) equals the ratio of the quantum yield of regulatory light-induced non-photochemical quenching to the quantum yield of constitutive non-regulatory non-photochemical quenching (˚ NPQ /˚ f,D ). A similar relationship is also found here for the PQ parameter (˚ P /˚ f,D ). © 2014 Elsevier GmbH. All rights reserved. Contents Introduction . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 132 Chl fluorescence and quantum yields . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 132 Pulse amplitude modulation technique for measurement of Chl fluorescence . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 133 The slow Chl FLI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 133 Saturation pulse method for determination of Chl fluorescence quenching . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 134 The relaxation analysis following the quenching analysis to discriminate particular types of non-photochemical quenching . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 136 Energy partitioning . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 138 Energy partitioning – employing the quenching analysis and consideration of active centers only . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 138 Demmig-Adams et al. (1996) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 138 Kato et al. (2003) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 138 Ishida et al. (2011) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 138 Genty et al. (1996), Cailly et al. (1996), and Hendrickson et al. (2004) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 139 Kramer et al. (2004) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 139 Energy partitioning – employing the quenching and relaxation analyses . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 140 Ahn et al. (2009) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 140 Kasajima et al. (2009) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 140 Guadagno et al. (2010) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 141 Energy partitioning – discrimination of the sustained regulatory non-photochemical quenching . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 141 Porcar-Castell et al. (2008) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 141 Porcar-Castell (2011) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 142 Energy partitioning – consideration of photoinactivated centers, in addition to active centers . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 142 ∗ Tel.: +420 58 563 4164. E-mail address: lazard@seznam.cz http://dx.doi.org/10.1016/j.jplph.2014.10.021 0176-1617/© 2014 Elsevier GmbH. All rights reserved.