Bioinformatic methods for eukaryotic RNA-Seq-based promoter identification Zur Erlangung des akademischen Grades eines Doktors der Naturwissenschaften an der Technischen Fakult¨ at der Universit¨ at Bielefeld vorgelegte Dissertation von Tobias Jakobi Juni 2014 Supervisors: Prof. Dr. Alfred P¨ uhler Prof. Dr. Alexander Goesmann