Escalante, T. et al.: Areas of endemism and thresholds of models 5 junio, 2013
D.R. © TIP Revista Especializada en Ciencias Químico-Biológicas, 16(1):5-17, 2013.
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Tania Escalante Tania Escalante Tania Escalante Tania Escalante Tania Escalante
1* 1* 1* 1* 1*
, Gerardo Rodríguez-Tapia , Gerardo Rodríguez-Tapia , Gerardo Rodríguez-Tapia , Gerardo Rodríguez-Tapia , Gerardo Rodríguez-Tapia
2
, Miguel Linaje , Miguel Linaje , Miguel Linaje , Miguel Linaje , Miguel Linaje
3
,
Patricia Illoldi-Rangel Patricia Illoldi-Rangel Patricia Illoldi-Rangel Patricia Illoldi-Rangel Patricia Illoldi-Rangel
4
and Rafael González-López and Rafael González-López and Rafael González-López and Rafael González-López and Rafael González-López
1
1
Museo de Zoología "Alfonso L. Herrera", Depto. de Biología Evolutiva, Facultad de Ciencias, Universidad Nacional
Autónoma de México. Apdo. Postal 70-399, C.P. 04510, México, D.F.
2
Unidad de Geomática, Instituto de Ecología,
Universidad Nacional Autónoma de México.
3
Lab. de Sistemas de Información Geográfica, Depto. de Zoología,
Instituto de Biología, Universidad Nacional Autónoma de México.
4
Biodiversity and Biocultural Conservation
Laboratory, Section of Integrative Biology, University of Texas at Austin. E-mail:
1*
tee@ibunam2.ibiologia.unam.mx,
jrglezlpz@gmail.com,
2
gerardo@ecologia.unam.mx,
3
miglinaje@gmail.com,
4
patz30@gmail.com
Nota: Artículo recibido el 18 de junio de 2012 y aceptado el 05 de
febrero de 2013.
ARTÍCULO ORIGINAL
A BSTRACT BSTRACT BSTRACT BSTRACT BSTRACT
We evaluated the relevance of threshold selection in species distribution models on the delimitation of areas
of endemism, using as case study the North American mammals. We modeled 40 species of endemic mammals
of the Nearctic region with Maxent, and transformed these models to binary maps using four different thresholds:
minimum training presence, tenth percentile training presence, equal training sensitivity and specificity, and
0.5 logistic probability. We analyzed the binary maps with the optimality method in order to identify areas of
endemism and compare our results regarding previous analyses. The majority of the species tend to have very
low values for the minimum training presence, whereas most of the species have a value of the tenth percentile
training presence around 0.5, and the equal training sensitivity and specificity was around 0.3. Only with the
tenth percentile threshold we recovered three out of the four patterns of endemism identified in North America,
and detected more endemic species.The best identification of areas of endemism was obtained using the tenth
percentile training presence threshold, which seems to recover better the distributional area of the mammals
analyzed.
Key Words: Analysis of endemicity, Mammalia, Maxent, Nearctic region, optimality.
R ESUMEN ESUMEN ESUMEN ESUMEN ESUMEN
Evaluamos la relevancia de la selección del umbral en los modelos de distribución de especies en la
delimitación de las áreas de endemismo, usando como un caso de estudio a los mamíferos de América del Norte.
Modelamos 40 especies de mamíferos endémicos de la región Neártica con Maxent, y transformamos esos
modelos a mapas binarios usando cuatro umbrales diferentes: presencia mínima de entrenamiento, percentil
diez de la presencia de entrenamiento, igual sensibilidad y especificidad de entrenamiento, y probabilidad
logística de 0.5. Los mapas binarios los analizamos con el método de optimación con el objeto de identificar
áreas de endemismo y comparar nuestros resultados con estudios previos. La mayoría de las especies mostró
tendencias hacia valores muy bajos de la presencia mínima de entrenamiento, mientras que la mayoría tuvo
un valor del percentil diez de la presencia de entrenamiento alrededor de 0.5, y de igual sensibilidad y
especificidad de entrenamiento alrededor de 0.3. Únicamente con el percentil diez de la presencia de
entrenamiento se recuperaron tres de los cuatro patrones de endemismo identificados para América del Norte
y se detectaron más especies endémicas. La identificación de áreas de endemismo más eficiente se obtuvo
usando el umbral del percentil diez de la presencia de entrenamiento, el cual parece recuperar mejor las áreas
de distribución de los mamíferos analizados.
Palabras Clave: Análisis de endemismo, Mammalia, Maxent, región Neártica, optimación.