Article original Génotypes d’échovirus 6 circulant dans la région de Monastir Genotypes of echovirus 6 in Monastir region K. Belguith * , L. Bouslama, K. Sdiri, S. Nsaibia, M. Ouni Laboratoire des maladies transmissibles et substances biologiquement actives, faculté de pharmacie, 5000, rue Avicenne, 5000 Monastir, Tunisie Reçu le 1 er septembre 2006 ; accepté le 2 octobre 2006 Disponible sur internet le 05 avril 2007 Résumé But de l’étude. – L’échovirus 6, un sérotype appartenant aux entérovirus humain B, fréquemment isolé en Tunisie et dans plusieurs pays du monde, souvent impliqué dans des pics épidémiques de méningites. Le but de ce travail est d’étudier les caractéristiques moléculaires des écho- virus 6 au niveau d’une région génomique partielle de 216 nucléotides (2874–3529) codant la protéine capsidale VP1 du côté 3’. Matériel et méthode. – Comparaison du profil génétique des séquences nucléotidiques de 25 souches d’échovirus 6. Résultats. – Il existe au moins neuf génotypes d’échovirus 6 qui circulent dans le monde dont trois génotypes circulant dans la ville de Monastir en Tunisie durant une même année d’étude. Conclusion. – Plusieurs génotypes d’un seul sérotype peuvent circuler en même temps et dans la même région, phénomène qui a été décrit comme atypique dans le cas des poliovirus. © 2007 Publié par Elsevier Masson SAS. Abstract Objective of the work. – Echoviruses of serotype 6 were reported to be endemic in Tunisia and even in other country over the world. they are associated with many outbreak meningitis. The Objective of this study was to genetecally charaterize echovirus 6 fields isolates. It gives a first approch on the molecular epidemiolgy of this serotype. Material and methods. – Phylogenetic analysis of partial sequence in the 3′half of the VP1 region (2874-3529) from 25 strains of echovirus 6. Results. – 9 genotypes of echovirus 6 were individualized. Study area was Monastir, a touristic tunisian city. Strains were isolated from wastewater durring one year, may correspond to three genotypes. Conclusion. – Many genotype could circulating during the same time and in the same region. This phenomena was reported to be atypic in the case of poliovirus. © 2007 Publié par Elsevier Masson SAS. Mots clés : Entérovirus ; Échovirus 6 ; Endémique ; Génotype ; Phylogénie Keywords: Enterovirus; Echovirus 6; Endemic; Genotype; Phylogeny 1. Introduction Les entérovirus humains sont des petits virus à ARN mono- caténaire de polarité positive, non enveloppés, à capside icosaédrique. Les entérovirus appartiennent à la famille des Picornaviridae. Ils sont subdivisés en cinq sous-genres regroupant 64 sérotypes. Ces sous-genres sont répartis en cinq sous-espèces : entérovirus humains A, B, C, D et poliovirus suivant le degré d’homologie des séquences nucléo- tidiques [1]. Les entérovirus ont un génome de petite taille. L’analyse comparative des séquences génomiques existantes montre une variabilité génétique remarquable. Cette variation repose sur des mutations ponctuelles, des insertions, des délétions et des recombinaisons par échange de segments génomiques. Les entérovirus possèdent une ARN polymérase dépourvue d’acti- http://france.elsevier.com/direct/PATBIO/ Pathologie Biologie 55 (2007) 316–322 * Auteur correspondant. Adresse e-mail : Kbelguith@yahoo.fr (K. Belguith). 0369-8114/$ - see front matter © 2007 Publié par Elsevier Masson SAS. doi:10.1016/j.patbio.2006.10.005