Managing Individuals’ Contributions to Maximize the Allelic Diversity Maintained in Small, Conserved Populations J. FERN ´ ANDEZ, ∗ †‡ M. A. TORO, ∗ AND A. CABALLERO† ∗ Departamento de Mejora Gen´ etica Animal, Instituto Nacional de Investigaci´ on y Tecnolog´ ıa Agraria y Alimentaria, Madrid, Spain †Departamento de Bioqu´ ımica, Gen´ etica e Inmunolog´ ıa, Facultad de Ciencias, Universidad de Vigo, Vigo, Spain Abstract: The maintenance of diversity is, from a genetic perspective, one of the key aims in a conservation program. Because the most widely used measure of genetic diversity is the expected heterozygosity of the pop- ulation, or gene diversity (GD), most research has been devoted to finding optimal strategies for maximizing this parameter. Little attention has been paid, however, to the development of strategies to manage allelic di- versity (AD), the number of alleles maintained in the population. Using computer simulations, we show that the strategies that maximize GD, by managing contributions from parents, keep levels of AD as high as strate- gies maximizing AD itself, for a wide range of situations including different numbers of molecular markers used and the possibility of evaluating a number of offspring per parent to make decisions. Because maxi- mization of GD also minimizes levels of inbreeding, this should be the strategy of choice in any conservation program. Key Words: expected heterozygosity, management strategies, molecular markers Manejo de Contribuciones de Individuos para Maximizar la Diversidad Al´ elica Mantenida en Poblaciones Conser- vadas Peque˜ nas Resumen: El mantenimiento de la diversidad es, desde una perspectiva gen´ etica, una de las metas clave de un programa de conservaci´ on. Debido a que la medida de diversidad gen´ etica m´ as utilizada es la het- erocigosidad esperada en la poblaci´ on, o diversidad g` enica (DG), la mayor parte de la investigaci´ on se ha enfocado a encontrar estrategias ´ optimas para maximizar el par´ ametro. Sin embargo, no se ha puesto mucha atenci´ on al desarrollo de estrategias para manejar la diversidad al´ elica (DA), (i.e., el n´ umero de alelos en la poblaci´ on). Utilizando simulaciones en computadora mostramos que estrategias que maximizan DG, medi- ante el manejo de contribuciones de padres, mantienen niveles de DA tan altos como con estrategias para maximizar DA mismo, para un amplio rango de situaciones incluyendo el uso de diferentes n´ umeros de marcadores moleculares y la posibilidad de evaluar a un n´ umero de descendientes por padre para tomar las decisiones. Debido a que la maximizaci´ on de DG tambi´ en minimiza los niveles de endogamia, esta debe ser la estrategia elegida en cualquier programa de conservaci´ on. Palabras Clave: estrategias de manejo, heterocigosidad esperada, marcadores moleculares ‡email jmj@inia.es Paper submitted July 28, 2003; revised manuscript accepted January 6, 2004. 1358 Conservation Biology, Pages 1358–1367 Volume 18, No. 5, October 2004