Use of Campylobacter bacteriophages as biocontrol agents within the farm-to-fork process I. NAFARRATE 1 , K. MIRANDA 1 , E. MATEO 2 and A. LASAGABASTER 1* 1 AZTI, Food Research Division, Parque Tecnológico de Bizkaia, Astondo bidea, Ed. 609, 48160 Derio, Bizkaia, Spain; 2 Department of Immunology, Microbiology and Parasitology, Faculty of Medicine and Nursing, UPV/EHU, Bilbao, Bizkaia, Spain. *Corresponding author: alasa@azti.es __________________________________________________________________________________ Campylobacteriosis is the most commonly reported foodborne disease in the European Union since 2005, with 246,158 confirmed cases in 2017 and an associated estimated annual cost of 2.4 billion €. Poultry is considered the natural reservoir of Campylobacter spp., and the consumption of raw and undercooked chicken meat the major source of human infection. In addition, the use of antimicrobials in primary production has caused the spread of antibiotic resistant Campylobacter strains, an additional threat to public health. Multiple mitigation strategies have been proposed for Campylobacter control in poultry. However, none of them have completely solve the problem. The application of specific bacteriophages appears as a promising alternative to antibiotics in order to reduce the burden of Campylobacter contamination within the farm-to-fork process. In this study, 304 phages were isolated from food and environmental samples. According to their genome size, new isolates were classified within campylophages of group II or Cp220virus (≈ 180 kb) and group III or Cp8virus (≈ 135 kb). The host range of all phages was also determined against a panel of 19 Campylobacter strains previously selected based on the typing results of a 100 strains collection. The characterization of their lytic capacities allowed the selection of the most promising 59 phages for their potential to be used as biocontrol agents. Their genetic diversity was then studied by restriction fragment length polymorphism (RFLP). HhaI RFLP classified 41 group III phages into five different patterns, while SmiI digestion did the same with 18 of group II. Further characterization of the selected phages is being carried out to determine their suitability for the future development of new effective campylophage-based products. La campilobacteriosis es la enfermedad transmitida por alimentos más común en la Unión Europea desde 2005, con 246,158 casos confirmados en 2017 y un coste asociado de 2,4 billones de euros al año. Las aves de corral son el reservorio natural de este patógeno y el consumo de carne de ave cruda o poco cocinada la fuente más común de infección. Además, el uso generalizado de antibióticos en la producción primaria ha provocado la propagación de cepas resistentes, una amenaza adicional para la salud pública. Aunque se han propuesto diferentes estrategias de mitigación para el control de Campylobacter, ninguna de ellas ha podido solventar el problema. La aplicación de bacteriófagos específicos de Campylobacter se presenta como una prometedora alternativa para reducir la prevalencia de este patógeno desde la granja hasta la mesa. En este estudio, se aislaron 304 fagos a partir de muestras ambientales y alimentarias. Según su tamaño de genoma, se clasificaron como fagos del grupo II o Cp220virus (≈ 180 kb), o, del grupo III o Cp8virus (≈ 135 kb). Su rango de huésped se determinó frente a 19 cepas de Campylobacter, previamente seleccionadas en base al tipado de una colección de 100 cepas. La caracterización de su capacidad lítica permitió la selección de los 59 fagos con mayor potencial para su empleo como agentes de biocontrol. Posteriormente, se estudió su diversidad genética mediante la técnica de polimorfismos de longitud de fragmentos de restricción (RFLP). La RFLP mediante el enzima HhaI clasificó 41 fagos del grupo II en cinco perfiles distintos, mientras que el SmiI hizo lo mismo con 18 del grupo II. Se continúa caracterizando los fagos seleccionados para determinar su idoneidad para el futuro diseño de nuevos y efectivos productos a base de fagos. __________________________________________________________________________________ Keywords: poultry, campilophages, food-safety, characterization, genetic diversity