مجله ع لمی زیستن زراعی گیاها فناوری ، شماره سال دهم سوم ، پ ی اپ ی س ی و سوم، بهار1400 ( 34 - 21 ) Crop Biotech. Spring (2021) 10(3): 21-34. DOI:10.30473/CB.2021.59060.1839 * ویسنده مسئول نرّدات شب سا : زهراE-mail: shobbar@abrii.ac.ir نواده خا ی ژنیWRKY رمزکننده گروه بزرگی از عواملسینوی رو هستند که در تنظیم ژن های پاسخنده ده به تنش هایستی زیستیرزی و غی دخیل می باشند. برایدآوری گرعضاء ا ایننواده خا ژنی درپونیکا ژا برنج ( Oryza sativa ssp. Japonica ) ، ستجوی جدگانه چن در پایگ اه های مختلفطلعاتی اعضا ای شناسای منظور به شد.نجام ا مرتبط ی جدید،tblastn براس اس توالی های حفاظت شده ینواده خا ژنیWRKY برنجطلعاتیه ا در پایگاNCBI واس مدل مخفیتجو بر اس جس مارکوف گرفت صورت. همرد ی ف ساز ی توال ی های پروتئ ی ن یده ازستفا ا با م افزار نرClustalW و آنال ی ز درخت ف ی لوژنت ی ک ی باستفاده ا از نرم افزار MEGA10 نجام ا گرد ید.اس براس نتایج به دست آمده،165 عضو از نواده خا ی ژنیWRKY در برنج یافت شد که63 ند. بود عضو جدید توالیادر مبنای تعد های موجود ب دمین هایWRKY ر انگشت و ساختا گروه روی در سه اصلی دسته بندی شاسد. بر این اس دن21 وتئین در پر گروهI ، 53 ر انگشت رویئین با ساختا پروتHxC 23 Cx 7 Cx گروه در III و82 ر انگشت رویئین با ساختا پروتHxH 23 - 22 Cx 5 - 4 Cx گروه در II گرفتند.ار قر مکان هر ژن رویخص شد. مشزوممو کرو گروه های نواده ژنیتلف خا مخWRKY زوممووی کرو ر بر های مخ تلف برنج توزیع شده اند.اد ژنرین تعد بیشتOsWRKY زوم یکمووی کرو ر( 32 عضو) رسیال بره دنباشتند. بار د قر ژن و تعیینلی تکمی های کاندید های هر یک از تنشش دخیل در تحمل به امیدبخستای در راز آنها، می توان ا ها افزایش تحمل به تنشی بات غذای امنیظر و تامین های مورد نده ازستفا ا را ه کارح مولکولی اصلک یا ژنتی مهندسی هایره برد به. واژه هایدی: کلی آنالیز فیلوژنتیک، برنج،پونیکا زیرگونه ژا، WRKY ، سینویامل رو عو. WRKY gene family encodes a large group of transcription factors regulating biotic and abiotic stress- responsive genes. In order to identify the WRKY gene family members in rice (Oryza sativa ssp. japonica), multiple searches were done in the related databases. Rice WRKY-conserved sequences were used as the templates for tBLASTN searches in datasets for finding new members. An HMM profile of WRKY domain was also used to find WRKY gene family. Multiple sequence alignment was done using clustalW software, and phylogenetic trees were drawn using MEGA10 software based on a neighbour-joining method with a 1000 repeats bootstrap index. According to the results, 165 members of the WRKY gene family were found in rice, of which 63 were new members. Sequences were divided into three main groups based on the number of WRKY domains and the structure of zinc-finger motifs. Conclusively, there were 21 proteins with two WRKY conserved domains in group I, 53 proteins with one WRKY conserved domain and Cx7Cx23HxC zinc- finger motif in group III and 82 proteins with one WRKY conserved domain and Cx4-5Cx22-23HxH zinc-finger motif in group II. The chromosomal location of OsWRKYs was detected on the rice genome. The different groups were distributed on various chromosomes. The greatest number of OsWRKY genes (32 members) were located on chromosome 1. Following complementary research and identification of promising candidate genes involved in tolerance to each stress, they can be used to increase tolerance to the desired stresses and provide food security using genetic engineering or molecular breeding approaches. Keywords: Oryza sativa, Japonica subspecies, Phylogenetic analysis, Transcription factors, WRKY » پژوهشیمقاله« ی و شناسای گروه بند ینواده خاسینویامل رو عوWRKY در برنجپونیکا ژا انییسا دری پر 2 ، 1 طمه فرزانه پیرآلقر ، فا 1 زارع ، ناصر 1 دات شبر سا ، زهرا 2 * ، زکریاسول اصغری ر 1 1 . گروهاهیلید و ژنتیک گی تو، نشگاه داق محقلی اردبیل، ایران ، اردبی. 2 . گروه زیستیستم شناسی س ها، پژوهش، کرج، ایرانج کشاورزیزش و ترویحقیقات، آموژی کشاورزی، سازمان ت گاه بیوتکنولو. ( تار ی خ در ی افت: 6 / 12 / 1399 - تار ی خ پذیرش: 26 / 3 / 1400 ) Identification and classification of the WRKY transcription factors family in Japonica rice Parisa Daryani 1,2 , Fatemeh Farzaneh Piralger 1 , Nasser Zare 1 , Zahra-Sadat Shobbar 2* , Rasool Asghari-Zakaria 1. Department of Plant Production and Genetics, University of Mohaghegh Ardabili, Ardabil, Iran 2. Department of Systems Biology, Agricultural Biotechnology Research Institute of Iran (ABRII), Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Karaj, Iran. (Received: Feb. 25, 2021 - Accepted: Jun. 16, 2021) چکیده Abstract