34 Molecular characterization of parasite resistant/susceptible Uruguayan Merino lambs C.G. Ciappesoni 1 , P. Nicolini, L. Kelly, N. Grasso, P. Peraza, A. Cabrera, V. Goldberg Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria – Uruguay Recibido: 2011-06-22 Aceptado: 2011-11-03 ABSTRACT. Gastrointestinal parasites (GIP) are one of the main sanitary and economic limitations for Uruguayan sheep production. Many authors suggest that there would be a possible relationship between microsatellites and sheep parasite resistance. Based on extreme fecal egg worm count expected progeny difference, 50 resistant (R) and 50 susceptible (S) lambs were chosen from a Merino flock. In order to investigate the genetic variability and structure in this flock, four polymorphic microsatellites (McM214, McM130, McM357 and CSRD2138) which are potentially associated with QTL for parasite resistance were analyzed. The number of alleles varied from 8 to 13 showing different frequencies, polymorphic information content values were >0.5 and the observed heterozygosity ranged from 0.735 to 0.773. A considerable genic and genotypic differentiation between R and S subpopulations was observed. McM214 showed a significant deviation from Hardy-Weinberg equilibrium from whole and S population. Fixation Indices (F IS ) values indicated also a heterozygote excess in the entire population. McM214 showed linkage disequilibrium with McM357 in the R sample, and with McM130 in the S sample. Population structure analysis proved the origin of two clusters (subpopulations) from two different lines (K=2, similarity coefficient =0.979). Polymorphism of these markers could be used in association analysis with GIP resistance / susceptibility. Key words: disease resistance, microsatellite, linkage disequilibrium, population genetics, animal breeding, sheep. Caracterización molecular de corderos Merino uruguayo resistentes/ susceptible a parásitos. RESUMEN. Parasitosis gastrointestinales (PGI) causadas por nematodos constituyen una de las principa- les limitantes sanitario-económicas para la producción ovina Uruguaya. Muchos autores sugieren una posi- ble relación entre la resistencia a parásitos y los microsatélites. De una población de merino de 357 individuos, se escogieron 50 animales resistentes (R) y 50 animales susceptibles (S) en base a la diferencia esperada en la progenie para conteo de huevos por gramo de materia fecal. Cuatro microsatélites (STR), McM214, McM130, McM357 y CSRD2138, potencialmente asociados a QTL a resistencia a parásitos. La frecuencia y el número de alelos varió para cada marcador desde 8 hasta 13, índices de contenido polimórficos todos mayores a 0.5, la Ho presentó valores entre 0.735-0.773. Evidenciando el elevado polimorfismo de estos microsatélites. Se observó diferenciación génica y genotípica significativa entre las dos subpoblaciones R y S. McM214 presento un desvío significativo del equilibrio Hardy-Weinberg. Los valores de los índices FIS indicaron en general un aumento de heterocigotos en toda la población. McM214 presentó ligamiento con el McM357 en la muestra R y con el McM130 en la muestra S. El análisis de la estructura poblacional evidenció el origen de las dos subpoblaciones a partir de dos líneas diferentes (K=2, coeficiente de similitud (SC)=0.979). La variabilidad genética detectada en esta población para los microsatélites analizados permitiría utilizarlos en análisis de asociación con resistencia/susceptibilidad a PGI. Este trabajo ofrece perspectivas interesantes para la incor- poración del uso de marcadores moleculares en el mejoramiento ovino en el Uruguay. Palabras clave: resistancia a enfermedades, microsatelites, desequilibrio de ligamentos, genetica, de pobla- ciones, cria animal, ovinos. Archivos Latinoamericanos de Producción Animal (Arch. Latinoam. Prod. Anim.) www.alpa.org.ve/ojs.index/php ISSN 1022-1301. 2012. Asociación Latinoamericana de Producción Animal. Vol 20, número 1-2: 34-41 1 Autor para la correspondencia, e-mail: gciappesoni@inia.org.uy