45 UHOD Number: 1 Volume: 28 Year: 2018 ULUSLARARASI HEMATOLOJI-ONKOLOJI DERGISI International Journal of Hematology and Oncology ARTICLE doi: 10.4999/uhod.182031 Interactive Effects of Common Haplotypes of Two Leukocyte Diapedesis-Related Genes, LFA-1 and JAM-A on Breast Cancer Risk Bengu TOKAT 1 , Tulin OZTURK 2 , M. Fatih SEYHAN 1 , Zerrin CALAY 2 , Sennur ILVAN 2 , Mete B. TUZUNER 1 , Oguz OZTURK 1 , Hulya YILMAZ-AYDOGAN 1 1 Istanbul University, Aziz Sancar Institute of Experimental Medicine, Department of Molecular Medicine 2 Istanbul University, Cerrahpasa Medical School, Department of Pathology, Istanbul, TURKEY ABSTRACT Leukocyte diapedesis is an important process in breast cancer etiopathogenesis. Therefore, Junctional adhesion molecule-A (JAM- A) and lymphocyte function-associated antigen-1 (LFA-1) genes are among potential candidate genes involved in breast cancer development. In the present study, JAM-A rs790056 (T>C), LFA-1 rs8058823 (A>G) and LFA-1 rs2230433 (C>G) gene variations and their associations with breast cancer risk were investigated in breast cancer patients and healthy subjects. The JAM-A and LFA- 1 genotypes were determined in 108 breast cancer patients and 63 healthy controls with Polymerase Chain Reaction- Restriction Fragment Length Polymorphism (PCR-RFLP) assay. LFA-1 rs8058823 common AA genotype (χ 2 = 6.062, p= 0.014) and A allele frequency (p= 0.001) and LFA-1 rs2230433 rare GG genotype frequency (p= 0.048) was higher in the patient group compared with controls. The TA haplotype (JAM-A rs790056-T, LFA-1 rs8058823-A alleles) frequency was significantly increased in the patient group compared with controls (p= 0.0173), while the TG haplotype (JAM-A rs790056-T, LFA-1 rs8058823-G alleles) and CG haplotype (LFA-1 rs2230433-C, LFA-1 rs8058823-G alleles) frequencies were significantly lower in the patient group compared with controls (p= 0.0051 and p= 0.002, respectively). In addition, the TCG haplotype (JAM-A rs790056-T, LFA-1 rs2230433-C, LFA-1 rs8058823-G alleles) frequency was significantly lower in the patient group compared with controls (p= 0.0096). Haplotype analysis confirmed that the LFA-1 rs8058823 is more effective in breast cancer risk than LFA-1 rs2230433 and JAM-A rs790056. LFA-1 rs8058823 A allele may be related to breast cancer risk, influencing leukocyte diapedesis. Our findings indicate that functional gene variations associated with leukocyte diapedesis may affect breast cancer risk. Keywords. Breast cancer, Gene, Junctional adhesion molecule-A, Lymphocyte function-associated antigen-1, Haplotype ÖZET Lökosit Diapeziyle İlişkili LFA-1 ve JAM-A Genlerindeki Yaygın Haplotiplerin Meme Kanseri Riskinde İnteraktif Etkileri Lökosit diapedezi meme kanseri etyopatojenezinde önemli bir süreçtir. Bu nedenle, Bağlantı Adezyon Molekülü-A (JAM-A) ve lenfosit fonksiyon ilişkili antijen-1 (LFA-1) genleri meme kanseri gelişiminde rol oynayan potansiyel aday genler arasındadır. Bu çalışmada meme kanseri hastaları ve sağlıklı bireylerde JAM-A rs790056 (T>C), LFA-1 rs8058823 (A>G) ve LFA-1 rs2230433 (C>G) gen varyasyonlarının meme kanseri riski ile ilişkileri araştırıldı. JAM-A ve LFA-1 genotipleri 108 meme kanseri hastası ve 63 sağlıklı kontrolde polimeraz zin- cir reaksiyonu- Restriksiyon Fragmanı Uzunluk polimorfzmi (PZR-RFUP) teknikleri kullanılarak belirlenmiştir. Hasta grubunda kontrol grubuyla karşılaştırıldığında LFA-1 rs8058823 yaygın AA genotipi (χ 2 = 6.062, p= 0.014), A allel frekansı (p= 0.001) ve LFA-1 rs2230433 nadir GG genotip frekansı (p= 0.048) yüksektir. Hasta grubunda kontrole kıyasla TA haplotip (JAM-A rs790056-T, LFA-1 rs8058823- A allelleri) frekansı anlamlı olarak yüksek gözlenirken (p= 0.0173), TG haplotip (JAM-A rs790056-T, LFA-1 rs8058823-G allelleri) ve CG haplotip (LFA-1 rs2230433-C, LFA-1 rs8058823-G allelleri) frekansları anlamlı olarak düşüktür (sırasıyla, p= 0.0051 ve p= 0.002). Ayrıca TCG haplotip (JAM-A rs790056-T, LFA-1 rs2230433-C, LFA-1 rs8058823-G allelleri) frekansı hasta grubunda kontrole göre anlamlı olarak düşüktür (p= 0.0096). Haplotip analizi LFA-1 rs8058823’in meme kanseri riskinin belirlenmesinde LFA-1 rs2230433 ve JAM-A rs790056’den daha etkili olduğunu doğrulamaktadır. LFA-1 rs8058823 A alleli lökosit diapedezini etkileyerek meme kanser riski ile ilişkili olabilir. Bulgularımız lökosit diapedezi ile ilişkili fonksiyonel gen varyasyonlarının meme kanseri riskini etkileyebileceğine işaret etmektedir. Anahtar Kelimeler: Meme kanseri, Lökosit Bağlantı Adezyon Molekülü-A, lenfosit fonksiyon ilişkili antijen-1, Haplotip