QUANTUM, Jurnal Inovasi Pendidikan Sains, Vol. 8, No.1, 2017, 1-12 1 Diterbitkan oleh Program Studi Pendidikan Kimia FKIP Universitas Lambung Mangkurat pISSN: 2086-7328, eISSN: 2550-0716. Terindeks di SINTA, IPI Portal Garuda, IOS, Google Scholar PROTEOMIK: DATABASE DAN TEKNOLOGI Proteomics: Database and Technology Azmi Azhari 1,2 *, Deden Jalaludin 1 , Ari Irawan 1 1 Tadris IPA Biologi, IAIN Syekh Nurjati, Jl. Perjuangan Bypass Sunyaragi, Cirebon 2 Departemen Biokimia, Institut Pertanian Bogor, Jl. Agatis 16680 Sukadamai Tanah Sereal, Bogor *email: azmi.azhari12p@apps.ipb.ac.id Abstrak. Dewasa ini bidang proteomik menjadi salah satu displin keilmuan yang menjadi sorotan. Integrasi kajian proteomik dan bioinformatika menghubungkan antara database dan teknologi. Database sangat membantu dalam penelitian bidang proteomik. Database terintegrasikan dalam eksperimen proteomik, yang bertujuan penentuan identitas, karakteristik dan interaksi protein. Sebuah aplikasi berupa The GDPE adalah aplikasi berbasis web dengan database relasional berdasarkan format PRIDE XML. Urutan protein database menyediakan urutan peptida yang akan dicocokkan dengan spektrum massa tandem oleh mesin pencari. Mempelajari proteomik menggunakan alat canggih yang disebut MALDI singkatan dari Matrix Assisted Laser Disorption/Ionization, dengan alat ini akan diketahui struktur dan fungsi suatu protein. Teknik yang digunakan dalam mempelajari proteomik diantaranya ialah analisis 2D berupa gel elektroforesis sehingga dapat memisahkan, mengidentifikasi dan mengukur berat molekulnya. Teknologi lain ialah spektrometri massa yang sangat sensitif, dan kromatografi cair berpeforma tinggi: High Performance Liquid Chromatography (HPLC). Kata kunci: proteomik, database, teknologi proteomik Abstract. Today the field of proteomics become one of the scientific disciplines that the spotlight of science. The integration of proteomics and bioinformatics studies linking between the database and technology. Databases are very helpful in the field of proteomics research. Database integrated into the proteomics experiment, aimed at determining the identity, characteristics, and interactions of proteins. An application form The GDPE is a web-based application with a relational database based PRIDE XML format. Protein sequence database provides peptide sequences that will be matched with tandem mass spectrum by search engines. Proteomic study the use of advanced tools called MALDI stands for Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization, with this tool will be known about the structure and function of a protein. The technique used in the study of proteomics analysis of which is in the form of 2D electrophoresis gel so as to separate, identify and measure the molecular weight. Another technology is highly sensitive mass spectrometry, and High-Performance Liquid Chromatography (HPLC). Keywords: proteomics, database, proteomics technology PENDAHULUAN Proteomik memegang peranan besar dalam memahami sistem dan proses biologi (Kenyon et al., 2002). Proteomik pertama kali dikenalkan istilahnya pada tahun 1995 menjadi disiplin ilmu baru (Wasinger et al., 1995). Proteomik mempelajari tentang stuktur, sifat dan fungsi protein. Sifat protein yang meliputi