Acta Limnol. Bras., 2009, vol. 21, no. 3, p. 299-308. and triggers the environmental set for bloom outbreak at Arraial and Mangueira bays. Ever since, the frequency and density of blooms in- creased up to a level that Mangueira bay was included in the list of world’s dead zones (Diaz and Rosenberg, 2008) due to the constant extremely low Dissolved Oxygen con- centration (DO) and high eutrophication levels. Tose two variables are detrimental to aquatic system biodiversity because they favor algae groups with wider environmental requirements such as cyanobacteria. Tis group can intake atmosphere oxygen, and control light availability by mov- ing up and down in the water column, afecting the entire 1. Introduction Algal blooms represent a signifcant and growing threat to aquatic systems, since it spoils the water quality for hu- man and ecological uses. Some algae genera produce toxins, which can be harmful to human healthy and fsheries. Te occurrence of cyanobacterial blooms, mainly the genera Aphanothece sp., Anabaena sp. and Microcystis sp. in the Patos Lagoon located in Rio Grande do Sul state, has been reported since early 1980’s (Betito, 1984; Matthiensen et al., 1999; Yunes, 2009). Tose authors relate the blooms to the increasing water pollution from untreated domestic and industrial sewage from Rio Grande urban area. Te sewage increases the nutrient input beyond natural level Mapping potential cyanobacterial bloom using Hyperion/EO-1 data in Patos Lagoon estuary Mapeamento de potenciais forações de cianobactérias usando imagem Hyperion/EO-1 no estuário da Lagoa dos Patos Lobo, FL. 1 , Barbosa, CC. 1 , Novo, EMML. 1 and Yunes, JS. 2 1 Divisão de Sensoriamento Remoto – DSR, Instituto Nacional de Pesquisas Espaciais – INPE, CP 515, CEP 12201-970, São José dos Campos, SP, Brazil e-mail: lobo@dsr.inpe.br; claudio@dpi.inpe.br; evlyn@dsr.inpe.br 2 Unidade de Pesquisa em Cianobactérias – UPC, Universidade Federal do Rio Grande – UFRG, CP 474, CEP 96201-900, Rio Grande, RS, Brazil e-mail: jsyunes@furg.br Abstract: Aim: Tis paper proposes an approach for using remote sensing data for identifcation and mapping of cyanobacterial blooms; Methods: It uses two sets of spectra (empirical and theoretical) as reference to classify the areas of cyanobacteria blooms using a Hyperion image acquired over the Patos Lagoon, located in Rio Grande do Sul State, Brazil. To circumvent cyanobacteria misclassifcation due to suspended inorganic particle (SIP) scattering, pigment band ratios – phycocyanin (650/620 nm) and chlorophyll-a (700/680 nm) - were applied; Results: An area of 22.5 km 2 prone to cyanobacterial blooms was mapped into 5 classes with chlorophyll-a concentration varying from 8 to 1,000 μg.L –1 using both, empirical and theoretical spectra; Conclusions: Te results corroborate the general spectral features of cyanobacterial blooms and indicated that band ratios operation removed the areas afected by high concentrations of SIP. Keywords: phycocyanin, chlorophyll-a, remote sensing, hyperespectral, Patos Lagoon. Resumo: Objetivo: Este artigo apresenta um método de identifcação e mapeamento de forações de cianobatérias utilizando imagem do sensor hiperespectral Hyperion/EO-1; Métodos: O método aplica dois conjuntos de curvas espectrais (uma empírica e outra teórica) como referência para classifcar áreas potenciais de ocorrência de cianobactérias na Lagoa dos Patos localizada no Estado do Rio Grande do Sul Rio Grande, Brasil. De modo a evitar que partículas inorgânicas fossem indevidamente classifcadas como cianobactérias devido ao espalhamento da radiação por partículas inorgânicas em suspensão (PIS) foi realizada a intersecção das áreas resultantes do cálculo da razão entre as bandas referentes às absorções pela fcocianina (650/620 nm) e clorofla-a (700/680 nm); Resultados: Uma área total de 22,5 km 2 potencial na ocorrência de cianobactéria foi identifcada e classifcada em 5 classes de concentrações de clorofla-a variando entre 8 e 1000 μg.L –1 a partir dos conjuntos de espectros de referência – empírico e teórico – com 88% de similaridade entre eles; Conclusões: Os resultados corroboram as feições espectrais de forações de cianobactérias e indicam que as áreas afetadas pelo efeito de espalhamento pela presença de altas concentrações de PIS foram removidas pela metodologia aplicada. Palavras-chave: fcocianina, clorofla-a, sensoriamento remoto, hiperespectral, Lagoa dos Patos. Physical Limnology