ГЕНОМНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ ДЛЯ ОБЕСПЕЧЕНИЯ БИОЛОГИЧЕСКОЙ БЕЗОПАСНОСТИ И ТЕХНОЛОГИЧЕСКОЙ НЕЗАВИСИМОСТИ 118 РАЗРАБОТКА ПОДХОДОВ ДЛЯ ДЕТЕКЦИИ ПРОВИРУСНОЙ ДНК ВИРУСА ИММУНОДЕФИЦИТА ЧЕЛОВЕКА (ВИЧ-1), ИНТЕГРИРОВАННОЙ В ГЕНОМ ЧЕЛОВЕКА, В УЛЬТРАНИЗКИХ КОНЦЕНТРАЦИЯХ С ПРИМЕНЕНИЕМ СИСТЕМЫ CRISPR/CAS М.А. Тюменцева, А.И. Тюменцев, В.Г. Акимкин ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора, Москва Для эффективного функционирования надзорных и мониторинговых служб необходимо внедрение в практику их работы современных молекулярных технологий. Поэтому по-прежнему актуальной остаётся задача разработки новых эффективных методик выявления нуклеиновых кислот возбудителей социально значимых инфекционных забо- леваний, например ВИЧ, в том числе основанных на применении систем направленного редактирования генома CRISPR/CAS. В настоящей работе были разработаны направ- ляющие РНК и специфические олигонуклеотиды для предварительной амплификации высоко консервативных участков генома ВИЧ-1. Разработанные направляющие РНК позволяют выявлять единичные копии провирусной ДНК ВИЧ-1 in vitro в составе рибонуклеопротеиновых комплексов CRISPR/CAS, в биологических образцах после пред- варительной амплификации. Ключевые слова: CRISPR/CAS нуклеаза, направляющая РНК, рибонуклеопротеиновый комплекс CRISPR/CAS, предварительная амплификация, ДНК ВИЧ-1 DOI: htps://doi�org/10�36233/978-5-9900432-9-9-118 DEVELOPMENT OF APPROACHES FOR DETECTION OF GENOME-INTEGRATED PROVIRAL DNA OF THE HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS (HIV-1) IN ULTRA LOW CONCENTRATIONS USING THE CRISPR/CAS SYSTEM M.A. Tyumentseva, A.I. Tyumentsev, V.G. Akimkin Federal Budget Institute of Science «Central Research Institute of Epidemiology», Moscow, Russia For the efective functioning of supervisory and health monitoring services, it is necessary to introduce modern molecular technologies into their practice. Terefore, the task of developing new efective methods for detecting pathogen, for example HIV, based on CRISPR/CAS genome editing systems, remains urgent. In the present work, guide RNAs and specifc oligonucleotides were developed for preliminary amplifcation of highly conserved regions of the HIV-1 genome. Te developed guide RNAs make it possible to detect single copies of HIV-1 proviral DNA in vitro as part of CRISPR/CAS ribonucleoprotein complexes in biological samples afer preliminary amplifcation. Key words: CRISPR/CAS nuclease, guide RNA, ribonucleoprotein complex CRISPR/CAS, preliminary amplifcation, HIV-1 DNA DOI: htps://doi�org/10�36233/978-5-9900432-9-9-118